MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sakei subsp. sakei 23K chromosome

Total Repeats: 33954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007576	GCTT	2	8	308	315	0 %	50 %	25 %	25 %	81427617
2	NC_007576	ACT	2	6	329	334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427617
3	NC_007576	AGA	3	9	485	493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427617
4	NC_007576	GCG	2	6	606	611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427617
5	NC_007576	TGG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427617
6	NC_007576	GAA	2	6	624	629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427617
7	NC_007576	CTT	2	6	653	658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427617
8	NC_007576	TGG	2	6	662	667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427617
9	NC_007576	GCAA	2	8	695	702	50 %	0 %	25 %	25 %	81427617
10	NC_007576	AACG	2	8	734	741	50 %	0 %	25 %	25 %	81427617
11	NC_007576	GAA	2	6	797	802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427617
12	NC_007576	TTA	2	6	843	848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427617
13	NC_007576	GAT	2	6	852	857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427617
14	NC_007576	AAG	2	6	877	882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427617
15	NC_007576	AAG	2	6	889	894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427617
16	NC_007576	TTC	2	6	897	902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	81427617
17	NC_007576	AGA	2	6	1103	1108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427617
18	NC_007576	GGT	2	6	1295	1300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427617
19	NC_007576	CATG	2	8	1463	1470	25 %	25 %	25 %	25 %	81427617
20	NC_007576	ATG	2	6	1777	1782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427618
21	NC_007576	AAC	2	6	1805	1810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427618
22	NC_007576	AAG	2	6	1849	1854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427618
23	NC_007576	A	7	7	1918	1924	100 %	0 %	0 %	0 %	81427618
24	NC_007576	GTC	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427618
25	NC_007576	GAA	2	6	1938	1943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427618
26	NC_007576	A	6	6	1989	1994	100 %	0 %	0 %	0 %	81427618
27	NC_007576	AGA	2	6	2000	2005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427618
28	NC_007576	AAT	2	6	2028	2033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427618
29	NC_007576	ACA	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427618
30	NC_007576	AAC	2	6	2158	2163	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427618
31	NC_007576	TCA	2	6	2332	2337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427618
32	NC_007576	GAT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427618
33	NC_007576	TTA	2	6	2460	2465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427618
34	NC_007576	TCA	2	6	2505	2510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427618
35	NC_007576	ATT	2	6	2634	2639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427618
36	NC_007576	GAA	2	6	2670	2675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427618
37	NC_007576	ACA	2	6	2766	2771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427618
38	NC_007576	GCT	2	6	2790	2795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427618
39	NC_007576	AAG	2	6	3171	3176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427619
40	NC_007576	ATT	2	6	3182	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427619
41	NC_007576	TGA	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427619
42	NC_007576	ACA	2	6	3325	3330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427619
43	NC_007576	AATT	2	8	3525	3532	50 %	50 %	0 %	0 %	81427620
44	NC_007576	AT	3	6	3667	3672	50 %	50 %	0 %	0 %	81427620
45	NC_007576	CGT	2	6	3685	3690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427620
46	NC_007576	GGA	2	6	3703	3708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	81427620
47	NC_007576	TCATT	2	10	3745	3754	20 %	60 %	0 %	20 %	81427620
48	NC_007576	AAC	2	6	3822	3827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427620
49	NC_007576	GCCAA	2	10	3858	3867	40 %	0 %	20 %	40 %	81427620
50	NC_007576	TTTA	2	8	3876	3883	25 %	75 %	0 %	0 %	81427620
51	NC_007576	CAA	2	6	3950	3955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427620
52	NC_007576	AGA	2	6	4039	4044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427620
53	NC_007576	GAA	2	6	4064	4069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427620
54	NC_007576	CAA	2	6	4076	4081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427620
55	NC_007576	ACA	2	6	4102	4107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427620
56	NC_007576	ACG	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427620
57	NC_007576	GAT	2	6	4154	4159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427620
58	NC_007576	CAA	2	6	4211	4216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427620
59	NC_007576	TGA	2	6	4257	4262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427620
60	NC_007576	TTA	2	6	4289	4294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427620
61	NC_007576	TGT	2	6	4305	4310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427620
62	NC_007576	TTG	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427620
63	NC_007576	A	6	6	4403	4408	100 %	0 %	0 %	0 %	81427620
64	NC_007576	ATT	2	6	4412	4417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427620
65	NC_007576	CG	3	6	4425	4430	0 %	0 %	50 %	50 %	81427620
66	NC_007576	GTC	2	6	4451	4456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427620
67	NC_007576	AGA	2	6	4459	4464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427620
68	NC_007576	GAT	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
69	NC_007576	AGA	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427621
70	NC_007576	ATG	2	6	4584	4589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
71	NC_007576	CAT	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427621
72	NC_007576	ATT	2	6	4694	4699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427621
73	NC_007576	TGA	2	6	4711	4716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
74	NC_007576	ATA	2	6	4764	4769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427621
75	NC_007576	GGT	2	6	4868	4873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427621
76	NC_007576	GGC	3	9	4880	4888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427621
77	NC_007576	TGG	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427621
78	NC_007576	GTT	2	6	4964	4969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427621
79	NC_007576	GGC	2	6	4976	4981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427621
80	NC_007576	TTA	2	6	4987	4992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427621
81	NC_007576	GAACAT	2	12	5051	5062	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	81427621
82	NC_007576	AAG	2	6	5273	5278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427621
83	NC_007576	TGA	2	6	5290	5295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
84	NC_007576	CAA	2	6	5389	5394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427621
85	NC_007576	CAA	2	6	5469	5474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427621
86	NC_007576	TGT	2	6	5542	5547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427621
87	NC_007576	GGC	2	6	5710	5715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427621
88	NC_007576	GCT	2	6	5729	5734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427621
89	NC_007576	CG	4	8	5738	5745	0 %	0 %	50 %	50 %	81427621
90	NC_007576	GAA	2	6	5758	5763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427621
91	NC_007576	AGT	2	6	5810	5815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
92	NC_007576	ATT	2	6	5836	5841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427621
93	NC_007576	TCG	2	6	5844	5849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427621
94	NC_007576	CGG	2	6	5863	5868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427621
95	NC_007576	A	6	6	5955	5960	100 %	0 %	0 %	0 %	81427621
96	NC_007576	GAA	2	6	5972	5977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427621
97	NC_007576	CCGATG	2	12	6066	6077	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	81427621
98	NC_007576	TTA	2	6	6101	6106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427621
99	NC_007576	ACC	2	6	6169	6174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	81427621
100	NC_007576	GAT	2	6	6199	6204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
101	NC_007576	TGA	2	6	6220	6225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
102	NC_007576	GCCA	2	8	6308	6315	25 %	0 %	25 %	50 %	81427621
103	NC_007576	AAC	2	6	6325	6330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427621
104	NC_007576	GAA	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427621
105	NC_007576	GAA	2	6	6446	6451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427621
106	NC_007576	GTA	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427621
107	NC_007576	TTG	2	6	6632	6637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427622
108	NC_007576	AAG	2	6	6736	6741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427622
109	NC_007576	CAA	2	6	6960	6965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427622
110	NC_007576	GC	3	6	7027	7032	0 %	0 %	50 %	50 %	81427622
111	NC_007576	GAC	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427622
112	NC_007576	CCAT	2	8	7124	7131	25 %	25 %	0 %	50 %	81427622
113	NC_007576	CAA	2	6	7154	7159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427622
114	NC_007576	CCG	2	6	7160	7165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	81427622
115	NC_007576	GATG	2	8	7170	7177	25 %	25 %	50 %	0 %	81427622
116	NC_007576	TGG	2	6	7203	7208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427622
117	NC_007576	TTACG	2	10	7265	7274	20 %	40 %	20 %	20 %	81427622
118	NC_007576	CAA	2	6	7347	7352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	81427622
119	NC_007576	TGAT	2	8	7454	7461	25 %	50 %	25 %	0 %	81427622
120	NC_007576	AAT	2	6	7495	7500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427622
121	NC_007576	CTCATT	2	12	7527	7538	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	81427622
122	NC_007576	TGG	2	6	7544	7549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	81427622
123	NC_007576	ACT	2	6	7601	7606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427622
124	NC_007576	AAG	3	9	7616	7624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427622
125	NC_007576	TCG	3	9	7629	7637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	81427622
126	NC_007576	ATTTG	2	10	7644	7653	20 %	60 %	20 %	0 %	81427622
127	NC_007576	TAT	2	6	7719	7724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427622
128	NC_007576	ATC	2	6	7729	7734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	81427622
129	NC_007576	TTG	2	6	7768	7773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	81427622
130	NC_007576	ACAA	2	8	7796	7803	75 %	0 %	0 %	25 %	81427622
131	NC_007576	TCGT	2	8	7829	7836	0 %	50 %	25 %	25 %	81427622
132	NC_007576	AAT	2	6	7876	7881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	81427622
133	NC_007576	ATT	2	6	7942	7947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427622
134	NC_007576	ATG	2	6	7949	7954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427622
135	NC_007576	ATT	2	6	8001	8006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	81427622
136	NC_007576	GAA	3	9	8047	8055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427622
137	NC_007576	GGC	2	6	8131	8136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	81427622
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145	NC_007576	CAG	2	6	8597	8602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	81427622
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151	NC_007576	CGAAG	2	10	8934	8943	40 %	0 %	40 %	20 %	81427622
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158	NC_007576	TGA	2	6	9395	9400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	81427623
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263	NC_007576	AAG	2	6	15399	15404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	81427629
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265	NC_007576	GA	3	6	15478	15483	50 %	0 %	50 %	0 %	81427629
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